Килмес е един от най-старите аржентински футболни отбори. Основан е на 27 ноември 1887 година от Д. Т. Стивънсън под името Килмес Роувърс Клъб, като съставът е изцяло от британски имигранти. През 1900 г. е преименуван на Килмес Атлетик Клъб, а през 1950 година по желание на президента на Аржентина Хуан Перон името е променено на сегашното Килмес Атлетико Клуб, за да звучи по-испански.
Първата титла на отбора идва през 1912 година, когато е Килмес печели аржентинското първенство, което по това време е с аматьорски статут. През 1931 г. Килмес е един от осемнадесетте отбора, които сформират професионалното аржентинско първенство. Единствената професионална титла на отбора е от първенството Метрополитано през 1978 г. Освен нея, Килмес печели пет пъти шампионата на втора дивизия през 1949, 1961, 1975, 1987 и, 1991. Освен това има три участия на Копа Либертадорес – през 1979, 1982 и 2005 година. В професионалната ера Килмес има общо 28 сезона в първа, 53 сезона във втора и един сезон в трета дивизия.
Прякорът на отбора е “пивоварите” заради основния спонсор бира Килмес, която е най-популярната в страната. Отборът играе своите мачове на стадион “Сентенарио др. Хосе Луис Майснер”, който е с капацитет 30 200 души.
